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DNA揭示了中世纪欧洲和中东地区的肠道健康

本周发表的一项新研究表明,在过去的流行病研究中率先使用古细菌检测方法进行了首次尝试,以表征来自两个中世纪厕所的古肠内容物的微生物多样性。这些发现为工业化前农业人口的微生物群落提供了见识,这可能为解释现代微生物群落的健康提供了急需的环境。

多年来,科学家们注意到,与世界各地的狩猎和采集社区相比,生活在工业化社会中的人们具有明显不同的微生物组。因此,越来越多的证据表明,我们的微生物组的变化与现代工业化世界中的许多疾病(例如炎症性肠病,过敏和肥胖症)相关。当前的研究有助于表征肠道微生物群的变化,并强调了古代厕所作为生物分子信息来源的价值。

古代肠道微生物群系:探索历史肠

剑桥大学的Piers Mitchell通过分析不寻常的基质专门研究过去人们的肠内容。通过在显微镜下观察考古厕所和干燥粪便的内容,他和他的团队了解了困扰我们祖先的肠道寄生虫。

米切尔说:“显微分析可以显示出生活在肠道中的寄生虫卵,但是肠道中的许多微生物实在太小而看不见。”“如果我们要确定什么构成现代人健康的微生物组,那么我们应该开始研究那些在使用抗生素,快餐和其他工业化陷阱之前生活的祖先的微生物群。”

马克斯·普朗克人类历史科学研究所的古代细菌DNA专家,该研究的共同负责人Kirsten Bos首先对研究长期混乱的厕所内容的可行性持怀疑态度。

“一开始,我们不确定肠道内容物的分子特征是否会在厕所中存活数百年。迄今为止,我们在古代细菌回收中的许多成功都来自钙化组织,例如骨骼和牙结石,它们提供了截然不同的Bos说:“尽管如此,我真的希望这里的数据能够改变我的观点。”

研究小组分析了公元14至15世纪耶路撒冷和拉脱维亚里加的中世纪厕所的沉积物。第一个挑战是将曾经形成古老肠道的细菌与环境引入的细菌区分开来,这是使用考古材料不可避免的结果。

研究人员发现了各种各样的细菌,古细菌,原生动物,寄生蠕虫,真菌和其他生物,包括许多已知居住在现代人类肠道中的生物。

博斯总结说:“看来厕所确实是微观和分子信息的宝贵来源。”

没有现代匹配的古代微生物群系

MPI-SHH的博士校友Susanna Sabin共同领导了这项研究,将厕所的DNA与其他来源的厕所进行了比较,包括来自工业和觅食种群的微生物群落以及废水和土壤。

“我们发现耶路撒冷和里加的微生物组具有某些共同特征-它们确实表现出与现代猎人采集微生物群和现代工业微生物群的相似性,但相异之处在于它们形成了自己独特的群体。我们不知道现代来源含有我们在这里看到的微生物含量。”

许多人的粪便混杂在一起的厕所的使用,使研究人员对整个社区的微生物群落有了空前的见识。

米切尔解释说:“这些厕所为我们提供了比这些粪便样本更多的有关这些地区更广泛的工业前人口的代表性信息。”“结合光学显微镜和古代DNA分析的证据,我们可以鉴定出存在于数百年前的祖先的肠子中的各种生物。”

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点击次数:更新时间2020-10-09【打印此页】??【关闭
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