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科学家生产了首个全长蛋白的开源全原子模型

病毒SARS冠状病毒2(SARS-CoV-2)是2019年冠状病毒疾病(COVID-19)的已知原因。“穗”或S蛋白促进病毒进入宿主细胞。

科学家生产了首个全长蛋白的开源全原子模型

现在,来自韩国首尔国立大学,英国剑桥大学和美国利哈伊大学的一组研究人员共同合作,建立了首个全长S蛋白的开源全原子模型。研究人员说,这特别重要,因为S蛋白在病毒进入细胞中起着核心作用,使其成为疫苗和抗病毒药物开发的主要靶标。

细节可以在找到纸,只在线发表于“在病毒膜开发一个完全糖基化全长SARS-COV-2 S蛋白模型”物理化学杂志B的。

该视频演示说明了如何根据其SARS-CoV-2 S蛋白模型构建此膜系统。该模型构建程序是开放访问的,可以在CHARMM-GUI的主页上找到,方法是单击COVID-19存档链接,或者单击标题中的存档链接,然后单击左侧的COVID-19蛋白质链接。侧边栏。

CHARMM-GUI(图形用户界面)是由Lehigh大学生物科学和生物工程学系教授Wonpil Im开发的,该程序可简单,准确,快速地模拟复杂的生物分子系统。Im将其描述为“计算显微镜”,使科学家能够理解无法以其他任何方式观察到的分子水平相互作用。可以在此视频中找到有关CHARMM-GUI的更多信息。

Im说:“我们的模型是首个完全糖基化的全长SARS-CoV-2峰值(S)蛋白模型,可供其他科学家使用。”“我很幸运地与韩国首尔国立大学的Chaok Seok博士和英国剑桥大学的Tristan Croll博士进行了合作。我们的团队花了几天又一天的时间,从已知的冷冻电磁结构部分中非常仔细地构建了这些模型。建模非常具有挑战性,因为在许多地区,简单的建模无法提供高质量的模型。”

Im说,科学家可以使用这些模型进行创新和新颖的模拟研究,以预防和治疗COVID-19。

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标签: 全长蛋白 全原子模型
点击次数:更新时间2020-06-29【打印此页】??【关闭
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